Мглинская централизованная библиотечная система была организована 16 ноября 1978 года Приказом Мглинского районного отдела культуры от 16.11.1978 г. №62 в соответствии с Решением райисполкома от 16.06.1977 г. «О централизации сети государственных массовых библиотек Мглинского района», Приказом управления культуры от 06.09.1978 г. «О переводе библиотек Мглинского района на централизованную библиотечную систему обслуживания населения» и включала в себя: Мглинскую центральную библиотеку с детским отделением, отделом комплектования, обработки литературы и организации каталогов, отделом обслуживания читателей, отделом нестационарного обслуживания и обменно-резервных фондов и 26  филиалов (сельских библиотек).

   На основании Постановления администрации Мглинского района от 27.06.2006г. № 476 «О переименовании централизованной библиотечной системы и утверждении Устава в новой редакции» Мглинская централизованная библиотечная система  с 1 января 2006 года была переименована в муниципальное учреждение культуры «Межпоселенческая централизованная библиотечная система» муниципального образования Мглинский район.

Постановлением администрации Мглинского района от 30.11.2011 г. №1049 «Об изменении типа муниципального учреждения культуры «Межпоселенческая централизованная библиотечная система» муниципального образования Мглинский район»муниципальное учреждение культуры «Межпоселенческая централизованная библиотечная система» муниципального образования Мглинский район с 1 января 2012 года было переименовано в муниципальное бюджетное учреждение «Мглинскаямежпоселенческая централизованная библиотечная система».

В данный момент в структуру МБУ Мглинская МЦБС входят: Мглинскаямежпоселенческая центральная библиотека (головная библиотека с функциями центральной с функциональными отделами для взрослых), Мглинская детская библиотека (с функциональными отделами для детей) и 22 филиала, расположенных в поселениях района (сельские библиотеки).